В Академии работают следующие научные секции:

1.  Окружающая среда и здоровье
Руководители - Лучкевич Владимир Станиславович, заслуженный деятель науки, д.м.н., профессор; Филиппов Вадим Леонидович, д.м.н., профессор

2.  Охрана труда и безопасность жизни
Руководители - Толстунов Сергей Андреевич к.т.н., доцент; Рыбкин Леонид Всеволодович, к.т.н.

3.  Чрезвычайные ситуации
Руководители - Потехин Герман Сергеевич, заслуженный деятель науки и техники, д.т.н., профессор; Бузинов Александр Сергеевич, к.т.н.

4.  Радиационная безопасность
Руководители - Рылов Михаил Иванович, Перевощиков Сергей Георгиевич.

5.  Экология
Руководители - Фридман Кирилл Борисович, д.м.н., профессор; Ивахнюк Григорий Константинович, д.т.н., профессор.

6.  Образование
Руководители - Горшков Лев Капитонович, заслуженный деятель науки, д.т.н., профессор; Пешкова Нина Сергеевна.

7.  Горно-металлургическая
Руководители - Сизяков Виктор Михайлович, заслуженный деятель науки, д.т.н., профессор; Утков Владимир Афанасьевич, д.т.н., профессор.

8.  Духовное возрождение
Руководители - Кузионов Сергей Петровия, к.т.н.; Сойко Богдан Игоревич, кандидат богословия.

9.  Инженерная экология
Руководители - Николаев Николай Иванович, д.т.н., профессор; Дементьев Анатолий Алексеевич, доктор философии по техническим наукам

10.  Военная экология
Руководители - Летучий Юрий Александрович, д.т.н., профессор; Лушанкин Вячеслав Иванович, к.т.н., профессор.

11.  Юридическая
Руководители - Гаврилюк Олег Леонидович, заслуженный юрист РФ, профессор; Москаленко Татьяна Владимировна.

12.  Экономическа и управление
Руководители - Лукманов Юнис Халитович, д.э.н., профессор; Копейкин Юрий Михайлович, к.э.н.

13.  Культура
Руководители - Шварцкопф Юрий Алексеевич, к.э.н.; Белов Геннадий Васильевич.

14.  Экология человека и природы
Руководители - Захарьящев Василий Иванович, к.э.н.; Соколенко Виктор Николаевич, к.т.н.